RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384287.1

SNORD116-3-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 116-3, humanhuman

BASIC

Gene SNORD116-3, Length 95 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD116-3-201ENST00000384287 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 SEC23BQ15437 767 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 C4orf46Q504U0 113 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.97□□□□□ -1.61
SNORD116-3-201ENST00000384287 ISM1B1AKI9 464 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 FAM227AF5H4B4 570 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 H3BNC9 293 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 PRF1P14222 555 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 KLRC1P26715 233 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 MCM5P33992 734 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 MTHFSP49914 203 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ARHGEF7Q14155 803 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CNGA2Q16280 664 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 C10orf25Q5T742 122 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 RANBP10Q6VN20 620 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 SNX15Q9NRS6 342 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 COL20A1Q9P218 1284 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.96□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 RAB27BO00194 218 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 FRS3O43559 492 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 PIAS2O75928 621 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 PGDP52209 483 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 FMO1Q01740 532 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ZNF91Q05481 1191 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 DEUP1Q05D60 604 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 SLC29A2Q14542 456 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 FAM102BQ5T8I3 360 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 DENND2CQ68D51 928 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CUL5Q93034 780 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CHST8Q9H2A9 424 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CLIC1O00299 241 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TMPRSS11DO60235 418 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 RNF8O76064 485 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 IL1R1P14778 569 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CFHR3Q02985 330 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 STK3Q13188 491 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ODR4Q5SWX8 454 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 PI4KBQ9UBF8 816 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 DKK4Q9UBT3 224 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 MID2Q9UJV3 735 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.94□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 SCGB1D2O95969 90 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 ACVR2AP27037 513 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 NTSR1P30989 418 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 CPT1AP50416 773 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TTC3P53804 2025 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 LINC00205P59089 165 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 KCNB1Q14721 858 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 RNF220Q5VTB9 566 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 USP49Q70CQ1 688 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 SESTD1Q86VW0 696 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 KAZALD1Q96I82 304 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.93□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 MYMKA6NI61 221 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 INSIG1O15503 277 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 TLR2O60603 784 aa4.92□□□□□ -1.62
SNORD116-3-201ENST00000384287 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms