RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368102.5

SNHG28-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SNHG28, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28-201ENST00000368102 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.67□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 COL1A2P08123 1366 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 KLHL33A6NCF5 533 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 GLTPD2A6NH11 291 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 CBX6O95503 412 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 TMEM132DQ14C87 1099 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 MORF4L2Q15014 288 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PDK4Q16654 411 aa14.66□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 DPP9Q86TI2 863 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 XYLT1Q86Y38 959 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 UBA3Q8TBC4 463 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PEBP4Q96S96 227 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 SMC6Q96SB8 1091 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 TSPAN1O60635 241 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 MICAL2O94851 1124 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 T-ENOLP0DO92 83 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 GM2AP17900 193 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 INHBEP58166 350 aa14.66□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 KLC1Q07866 573 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 GRIK4Q16099 956 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 CDO1Q16878 200 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 C10orf82Q8WW14 230 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 TSC22D3Q99576 134 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 CALN1Q9BXU9 219 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 CYP3A43Q9HB55 503 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 SAR1AQ9NR31 198 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 DCTN4Q9UJW0 460 aa14.66□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 TYROBPO43914 113 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 PTPN4P29074 926 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PTPN7P35236 360 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 TRNP1Q6NT89 227 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 RFX6Q8HWS3 928 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 MFN1Q8IWA4 741 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 ZNF398Q8TD17 642 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 ACAP3Q96P50 834 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 NPHS2Q9NP85 383 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 RNF19AQ9NV58 838 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 C2orf71A6NGG8 1288 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 P4HA1P13674 534 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 KDELR1P24390 212 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 GTF2A2P52657 109 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 MXRA7P84157 204 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 KYAT1Q16773 422 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 GPR142Q7Z601 462 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 FNIP1Q8TF40 1166 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.65□□□□□ -0.06
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SNHG28-201ENST00000368102 TTC25Q96NG3 672 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 PAFAH2Q99487 392 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 DPP3Q9NY33 737 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 MORF4L1Q9UBU8 362 aa14.65□□□□□ -0.06
SNHG28-201ENST00000368102 FAM155BO75949 473 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 MIPP30301 263 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 GPD2P43304 727 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 BIRC2Q13490 618 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 IRGCQ6NXR0 463 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 LRRC8CQ8TDW0 803 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 MAML3Q96JK9 1138 aa14.64□□□□□ -0.07
SNHG28-201ENST00000368102 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.64□□□□□ -0.07
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