RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 RIPK1Q13546 671 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 PDK2Q15119 407 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 BSNDQ8WZ55 320 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DCLK3Q9C098 648 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10.96□□□□□ -0.65
SH3BP2-201ENST00000356331 GLI2P10070 1586 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB5O15062 677 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AXIN1O15169 862 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PLEKHA8P1O95397 391 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC16A2P36021 539 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 HERVK_113P62684 666 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOC3L1Q86VI1 746 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ATPAF2Q8N5M1 289 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GDF3Q9NR23 364 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EFCAB10A6NFE3 127 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CCDC154A6NI56 674 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 FKBP9O95302 570 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 APRTP07741 180 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GTF2IP78347 998 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKCQQ04759 706 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 STK4Q13043 487 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 IL17REQ8NFR9 667 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA2Q9UM82 520 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NEDD4P46934 1319 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MPOP05164 745 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKAR1AP10644 381 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TCF4P15884 667 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 COILP38432 576 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC9A5Q14940 896 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 XRRA1Q6P2D8 792 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GADL1Q6ZQY3 521 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RNFT2Q96EX2 444 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10.96□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GNB5O14775 395 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PHKA1P46020 1223 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL5P46777 297 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GPC3P51654 580 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNJ2P63252 427 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF846Q147U1 533 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ADHFE1Q8IWW8 467 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 COA7Q96BR5 231 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 THAP1Q9NVV9 213 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RAD51BO15315 384 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BMP3P12645 472 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPZA2P47755 286 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GCLMP48507 274 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MAPKAPK2P49137 400 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NR1D2Q14995 579 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 NEDD4LQ96PU5 975 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CARD8Q9Y2G2 431 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX13Q9Y5W8 968 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MADDQ8WXG6 1647 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 MYBPC2Q14324 1141 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GPD1LQ8N335 351 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 GIPC3Q8TF64 312 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 OSBPL11Q9BXB4 747 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PNPLA3Q9NST1 481 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 COMMD9Q9P000 198 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TBX22Q9Y458 520 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CPDO75976 1380 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 HEATR9A2RTY3 570 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 UCHL3P15374 230 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 C18orf8Q96DM3 657 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM9Q9C026 710 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 DGKIO75912 1065 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 KLRC1P26715 233 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 PLK4O00444 970 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 BTN3A3O00478 584 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 LSM8O95777 96 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF23P17027 643 aa10.95□□□□□ -0.66
SH3BP2-201ENST00000356331 SARSP49591 514 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms