RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 RNF43Q68DV7 783 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TTC7BQ86TV6 843 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK3Q8IZD9 2030 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 DCBLD2Q96PD2 775 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 AKT1P31749 480 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN5P54829 565 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 ATP2C2O75185 946 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 CCR3P51677 355 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RUNX3Q13761 415 aa4.63□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 GTSE1Q9NYZ3 720 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SUN2Q9UH99 717 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK13O15264 365 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ITGAVP06756 1048 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OR1E1P30953 314 aa4.63□□□□□ -1.67
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