RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318607.9

PABPC1-201, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PABPC1, Length 3,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-201ENST00000318607 ZBED1O96006 694 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 GJB1P08034 283 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 FAM200BP0CF97 657 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 GPC3P51654 580 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 BPIFB4P59827 614 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 CNGA3Q16281 694 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 SLC5A9Q2M3M2 681 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 WDR78Q5VTH9 848 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 SCINQ9Y6U3 715 aa14.76□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 UBE4BO95155 1302 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PSTPIP1O43586 416 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 USP12O75317 370 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PMLP29590 882 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ETFBP38117 255 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TFAP2BQ92481 460 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 WWP1Q9H0M0 922 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PDP2Q9P2J9 529 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ECE2O60344 883 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 OLIG2Q13516 323 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PCGF5Q86SE9 256 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 MPP5Q8N3R9 675 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 FAM49BQ9NUQ9 324 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 AMHP03971 560 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 MUTP22033 750 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 IGBP1P78318 339 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 GTF2BQ00403 316 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TRIM74Q86UV6 250 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TRIM73Q86UV7 250 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 C7orf31Q8N865 590 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 IWS1Q96ST2 819 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ASB3Q9Y575 518 aa14.75□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 LRP5O75197 1615 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 VAV1P15498 845 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 RBL1P28749 1068 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 INHBCP55103 352 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 OCRLQ01968 901 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ROR1Q01973 937 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ITGA9Q13797 1035 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 SLC15A2Q16348 729 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 APOPT1Q96IL0 206 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ZNF862O60290 1169 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 GLRBP48167 497 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 NUDT2P50583 147 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DPYSL3Q14195 570 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 PDK3Q15120 406 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 EFHC2Q5JST6 749 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 C6orf52Q5T4I8 152 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TRIM11Q96F44 468 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 MASTLQ96GX5 879 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 APOL2Q9BQE5 337 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 CISHQ9NSE2 258 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 STK24Q9Y6E0 443 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 A0A1B0GTW7 788 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 E7ENQ6 273 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TPST1O60507 370 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 TMEM191BP0C7N4 346 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 VCLP18206 1134 aa14.74□□□□□ -0.05
PABPC1-201ENST00000318607 CDKN2BP42772 138 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms