RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 CTAGE9A4FU28 777 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ENC1O14682 589 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 PDGFRAP16234 1089 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 GPD1P21695 349 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 COMTP21964 271 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 HFE2Q6ZVN8 426 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NT5DC3Q86UY8 548 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 KIF18AQ8NI77 898 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 COMMD8Q9NX08 183 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SCML2Q9UQR0 700 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CDH23Q9H251 3354 aa23.2■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 GLUD1P00367 558 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 LTFP02788 710 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 YWHAQP27348 245 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SLC1A1P43005 524 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 USP46P62068 366 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 MTMR3Q13615 1198 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TRNP1Q6NT89 227 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA1Q92805 767 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CLCN4P51793 760 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TWF1Q12792 350 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DEFB106AQ8N104 65 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CNPY3Q9BT09 278 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 USTQ9Y2C2 406 aa23.19■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 EPOPA6NHQ4 379 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CAPN9O14815 690 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SPOPO43791 374 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DAB1O75553 588 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SDC4P31431 198 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 MATKP42679 507 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 BSPRYQ5W0U4 402 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 FAM92AA1XBS5 289 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DPYSL4O14531 572 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NCK2O43639 380 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 MAN1A1P33908 653 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NOS2P35228 1153 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 EPHB3P54753 998 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 VEPH1Q14D04 833 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CCDC14Q49A88 953 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DCAF6Q58WW2 860 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 FBXO32Q969P5 355 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TLR10Q9BXR5 811 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 EHD2Q9NZN4 543 aa23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 FYNP06241 537 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CSH1P0DML2 217 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CSH2P0DML3 217 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NCAM1P13591 858 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DESP17661 470 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TAF10Q12962 218 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 PLD1Q13393 1074 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ACAP1Q15027 740 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 MON1AQ86VX9 555 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TTLL2Q9BWV7 592 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 RNF8O76064 485 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 C1RP00736 705 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 C8AP07357 584 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ATP11AP98196 1134 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 RPS6KA1Q15418 735 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 TAF12Q16514 161 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CDO1Q16878 200 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SCD5Q86SK9 330 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 EDEM1Q92611 657 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 GMIPQ9P107 970 aa23.16■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 RFXAPO00287 272 aa23.15■■□□□ 1.3
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