RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299855.9

MMP3-201, Transcript of matrix metallopeptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MMP3, Length 2,016 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3-201ENST00000299855 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ARAFP10398 606 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CCNB1P14635 433 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 HSPA6P17066 643 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FGFR4P22455 802 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 RFC4P35249 363 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 DNA2P51530 1060 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ORC1Q13415 861 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CNGA2Q16280 664 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SBK1Q52WX2 424 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 VPS36Q86VN1 386 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 P3H2Q8IVL5 708 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GJD3Q8N144 294 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PRR18Q8N4B5 295 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 C2orf69Q8N8R5 385 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CEP76Q8TAP6 659 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 HSPH1Q92598 858 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 RAB34Q9BZG1 259 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ACPTQ9BZG2 426 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GANQ9H2C0 597 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PDE7BQ9NP56 450 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 VPS28Q9UK41 221 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 AMFRQ9UKV5 643 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 EXOC7Q9UPT5 735 aa9.51□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 LRRD1A4D1F6 860 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 EXTL3O43909 919 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SMPD2O60906 423 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PSAPP07602 524 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 POTEJP0CG39 1038 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GNA11P29992 359 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GDI1P31150 447 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 HNF1BP35680 557 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 B2MP61769 119 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 KCNJ2P63252 427 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 KLRC3Q07444 240 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TRIM32Q13049 653 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ACVR2BQ13705 512 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 RNF43Q68DV7 783 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 IFNL1Q8IU54 200 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 DNAJC10Q8IXB1 793 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 OR2C3Q8N628 320 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TTC25Q96NG3 672 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 FNBP1Q96RU3 617 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PACSIN1Q9BY11 444 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CARD9Q9H257 536 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ERVV-1B6SEH8 477 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 TRAF5O00463 557 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 VWA5AO00534 786 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 MAGEB3O15480 346 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 ABCB7O75027 752 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SEC22BO75396 215 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 H2AFZP0C0S5 128 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 USP17L7P0C7H9 530 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GNAZP19086 355 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 SLC16A2P36021 539 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PTK2Q05397 1052 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 GRB10Q13322 594 aa9.49□□□□□ -0.89
MMP3-201ENST00000299855 PWP1Q13610 501 aa9.49□□□□□ -0.89
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