RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SCN4BQ8IWT1 228 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 CHPFQ8IZ52 775 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 PDCL2Q8N4E4 241 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 FGF11Q92914 225 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 KCNN1Q92952 543 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TIPINQ9BVW5 301 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 DPP3Q9NY33 737 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D14Q9P2M4 693 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa17.55■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0B4J269 797 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF840PA6NDX5 716 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM66O15016 1216 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SLC28A2O43868 658 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA12O60330 932 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 JUPP14923 745 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 MAGEA11P43364 429 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 LIG4P49917 911 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 CSRP3P50461 194 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SMTNP53814 917 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC173Q0VFZ6 552 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 LY6DQ14210 128 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 KIF19Q2TAC6 998 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 PKDCCQ504Y2 493 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ERICH1Q86X53 443 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM176AQ96HP8 235 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA17Q96L03 361 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TTLL2Q9BWV7 592 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 L1RE1Q9UN81 338 aa17.54■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 METTL12A8MUP2 240 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ18B7U540 433 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 PIGRP01833 764 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 NTRK1P04629 796 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 NEK4P51957 841 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 NCKAP1LP55160 1127 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 KCNK18Q7Z418 384 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 OSTM1Q86WC4 334 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 OTUB2Q96DC9 234 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ASB7Q9H672 318 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 FTSJ1Q9UET6 329 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 KCNG1Q9UIX4 513 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 DNM3Q9UQ16 869 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SNX11Q9Y5W9 270 aa17.53■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 PLXNA2O75051 1894 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 E2F8A0AVK6 867 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 HCRTO43612 131 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 BRINP1O60477 761 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 CCT8P50990 548 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 KCNH2Q12809 1159 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 BTBD8Q5XKL5 378 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SDE2Q6IQ49 451 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 SLC39A4Q6P5W5 647 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 TTC9Q92623 222 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF560Q96MR9 790 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ARID3AQ99856 593 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 MSTO1Q9BUK6 570 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 LRWD1Q9UFC0 647 aa17.52■□□□□ 0.4
SPCS1-201ENST00000233025 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 MYL7Q01449 175 aa17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF174Q15697 407 aa17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D25Q3MII6 688 aa17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF8Q969P0 613 aa17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 CEP295NLQ96MC4 621 aa17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 ITM2CQ9NQX7 267 aa17.51■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 PRRT4C9JH25 899 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 GFRA2O00451 464 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-19P01714 112 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 GRIK1P39086 918 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 PPP3CCP48454 512 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 GUCY1B3Q02153 619 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 COLEC12Q5KU26 742 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 HES3Q5TGS1 186 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 GRAMD4Q6IC98 578 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 FAM171BQ6P995 826 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 USP49Q70CQ1 688 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM25Q86YD3 366 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM86AQ8N2M4 240 aa17.5■□□□□ 0.39
SPCS1-201ENST00000233025 IGSF22Q8N9C0 903 aa17.5■□□□□ 0.39
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