RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 ZNF487B1APH4 448 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 EOMESO95936 686 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ARCQ7LC44 396 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ULK4Q96C45 1275 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 HES6Q96HZ4 224 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.56□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CASP1P29466 404 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 GRM5P41594 1212 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 NME3Q13232 169 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 RETSATQ6NUM9 610 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 PASD1Q8IV76 773 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TTC17Q96AE7 1141 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 KLRG1Q96E93 195 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 PDGFCQ9NRA1 345 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ADCY6O43306 1168 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 NDUFS3O75489 264 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CALB2P22676 271 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 VCPP55072 806 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 VSNL1P62760 191 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 GTF2H3Q13889 308 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DPYSL4O14531 572 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 KATNA1O75449 491 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 VCLP18206 1134 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 NOVP48745 357 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SKP1P63208 163 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 INPP5AQ14642 412 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 GRIK4Q16099 956 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CCDC189A1A4V9 331 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 MAPK1P28482 360 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 HSD17B3P37058 310 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 IFNAR2P48551 515 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 F5H5T6 163 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 RPN2P04844 631 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DNAJB1P25685 340 aa6.55□□□□□ -1.36
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SETX-201ENST00000224140 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 MTF1Q14872 753 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SDE2Q6IQ49 451 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 APBA2Q99767 749 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TRMOQ9BU70 441 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TRABDQ9H4I3 376 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SRGAP2O75044 1071 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 FCGR1AP12314 374 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 GFAPP14136 432 aa6.55□□□□□ -1.36
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SETX-201ENST00000224140 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 PANX3Q96QZ0 392 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TRIM4Q9C037 500 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 STARD7Q9NQZ5 370 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 HEATR9A2RTY3 570 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CA12O43570 354 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ST3GAL1Q11201 340 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CPA5Q8WXQ8 436 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CPNE1Q99829 537 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 MPP6Q9NZW5 540 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 KLRC4O43908 158 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 BMP10O95393 424 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 KIF19Q2TAC6 998 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 MYL2P10916 166 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 SLC6A3Q01959 620 aa6.55□□□□□ -1.36
SETX-201ENST00000224140 PPM1NQ8N819 430 aa6.55□□□□□ -1.36
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