RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 CBWD6Q4V339 395 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CBWD3Q5JTY5 395 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CBWD5Q5RIA9 395 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 NELFBQ8WX92 580 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 RNF38Q9H0F5 515 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CISHQ9NSE2 258 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 GMIPQ9P107 970 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 BEST1O76090 585 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 MORC3Q14149 939 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 EML3Q32P44 896 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 PPM1JQ5JR12 505 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 SLC35C1Q96A29 364 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.99■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 EML5Q05BV3 1969 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 GDF9O60383 454 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 OLFM2O95897 454 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 GJA4P35212 333 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 WHAMMQ8TF30 809 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 IL37Q9NZH6 218 aa22.98■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 COCHO43405 550 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 HOXA6P31267 233 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TUBP50607 506 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 SLC8A3P57103 927 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CETN1Q12798 172 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 WDR5BQ86VZ2 330 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TATDN2Q93075 761 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 ARID3AQ99856 593 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 PTPRDP23468 1912 aa22.97■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 USP24Q9UPU5 2620 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 DRD1P21728 446 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 BMP6P22004 513 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 ZXDBP98169 803 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 PAK1Q13153 545 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CUL2Q13617 745 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CAMK4Q16566 473 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 TTI2Q6NXR4 508 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CEP68Q76N32 757 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CD101Q93033 1021 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 CHFRQ96EP1 664 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.96■■□□□ 1.27
NME4-201ENST00000219479 FAM92AA1XBS5 289 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 ATG13O75143 517 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 FMO5P49326 533 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 GALK1P51570 392 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 STX17P56962 302 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 LRMPQ12912 555 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 DUSP16Q9BY84 665 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 SCML2Q9UQR0 700 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 LAMA1P25391 3075 aa22.95■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 CYP26A1O43174 497 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 TLR5O60602 858 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 GNA14O95837 355 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 EGFP01133 1207 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 RAD23BP54727 409 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 FBXO43Q4G163 708 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.94■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 E2F8A0AVK6 867 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 ADH1CP00326 375 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 NT5C1BQ96P26 610 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.93■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 HHLA1C9JL84 531 aa22.92■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NME4-201ENST00000219479 RNF40O75150 1001 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms