RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spag16Q8K450 639 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nudcd3Q8R1N4 363 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clptm1Q8VBZ3 664 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr458Q8VF80 313 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr457Q8VGP5 313 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ChiaQ91XA9 473 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf11Q99JX1 211 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam212aQ9CX62 282 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubxn11Q9D572 484 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lima1Q9ERG0 753 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r25W4VSP2 855 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sbno2Q7TNB8 1349 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fndc3c1Q6DFV6 1356 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyb5rlB1AS42 316 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tatdn2B7ZNL9 783 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbed6D2EAC2 980 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oog1E9Q5G7 496 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zc3h12bG3X9I7 835 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myl4P09541 193 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ass1P16460 412 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tfap2aP34056 437 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nr2c2P49117 596 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 S100bP50114 92 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SftpdP50404 374 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex2P55098 305 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3TQQ9 903 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 N4bp1Q6A037 893 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rad54bQ6PFE3 886 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r102Q7M717 329 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabbr2Q80T41 940 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fbxw8Q8BIA4 598 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nat14Q8BVG8 206 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppme1Q8BVQ5 386 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phactr3Q8BYK5 558 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wdr27Q8C5V5 780 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8CIL4 281 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tspan8Q8R3G9 235 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alg9Q8VDI9 611 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 HlcsQ920N2 722 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lpin3Q99PI4 848 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PapolbQ9WVP6 641 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pck1Q9Z2V4 622 aa6.86□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgef37A1IGU4 676 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm12394A2AKP6 982 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Skint3A7TZF0 458 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Serpinb3aG3X9V8 387 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ebf3O08791 596 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nedd9O35177 833 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EpoP07321 192 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ItgavP43406 1044 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Wnt10bP48614 389 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tnni3P48787 211 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mxi1P50540 228 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smad1P70340 465 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf1bP97358 586 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd15Q5F2F2 459 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2c29Q64458 490 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubxn7Q6P5G6 467 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cand1Q6ZQ38 1230 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam102aQ78T81 392 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam107aQ78TU8 144 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ItpkcQ7TS72 678 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp6nlQ80XC3 819 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bmt2Q8BXK4 403 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr20Q8BYC4 358 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atg16l1Q8C0J2 607 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kat14Q8CID0 779 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim61Q8JZK6 461 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myoz3Q8R4E4 245 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ascc2Q91WR3 749 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 SmtnQ921U8 923 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map4k3Q99JP0 894 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc12a9Q99MR3 914 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc103Q9D9P2 237 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ap2b1Q9DBG3 937 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rassf7Q9DD19 359 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mpp5Q9JLB2 675 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Piwil1Q9JMB7 862 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ClcnkbQ9WUB6 687 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CitP49025 2055 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc175E9PVB3 822 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 F6Y6L6 278 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ca8P28651 291 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alox15P39654 663 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MafbP54841 323 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc9Q3V038 219 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pdp2Q504M2 532 aa6.85□□□□□ -1.31
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmem45aQ60774 273 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 85.4 ms