RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	UBP1	P25037	809 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	RPA14	P50106	137 aa		3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
AI2	Q0055	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	TPD3	P31383	635 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	HUL5	P53119	910 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	MTC5	Q03897	1148 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	DAL5	P15365	543 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
AI2	Q0055	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	RRN7	P40992	514 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	YJL049W	P47048	450 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	TBF1	Q02457	562 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	TRS120	Q04183	1289 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	CAB1	Q04430	367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	YPR097W	Q06839	1073 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	YDL206W	Q12424	762 aa		3.54	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	MOD5	P07884	428 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	SEC6	P32844	805 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	TIM23	P32897	222 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	MNN1	P39106	762 aa		3.53	□□□□□ -1.84
AI2	Q0055	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	TOA1	P32773	286 aa		3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	FAA3	P39002	694 aa		3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	FIG4	P42837	879 aa		3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	PFD1	P46988	109 aa		3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YDL176W	Q12027	708 aa		3.53	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	MKK2	P32491	506 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YGR122W	P53272	402 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	FOL1	P53848	824 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RMD1	Q03441	430 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	ALR1	Q08269	859 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	CTR9	P89105	1077 aa		3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	COB	P00163	385 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	ERR1	P0CX10	437 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	ERR2	P0CX11	437 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YBR197C	P38306	217 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	NUP82	P40368	713 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	KTR7	P40504	517 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	HXT10	P43581	546 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YJR120W	P47157	116 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	EEB1	Q02891	456 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	GRX3	Q03835	250 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	NKP1	Q12493	238 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RPB10	P22139	70 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	KXD1	P53158	218 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RSC4	Q02206	625 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	TSC13	Q99190	310 aa		3.51	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RAD27	P26793	382 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	DUR3	P33413	735 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	HXT5	P38695	592 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.5	□□□□□ -1.85	not detected
AI2	Q0055	HXT13	P39924	564 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YGL081W	P53156	320 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	HXT17	P53631	564 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	HXT15	P54854	567 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YLR001C	Q07895	862 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YEN1	P40028	759 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	PIC2	P40035	300 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	HED1	Q03937	162 aa		3.5	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YPP1	P46951	817 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	MPH2	P0CD99	609 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	CDC34	P14682	295 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	PPG1	P32838	368 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	MNR2	P35724	969 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	YGR021W	P53212	290 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	GAS4	Q08271	471 aa		3.49	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	HAP4	P14064	554 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	UGA4	P32837	571 aa		3.48	□□□□□ -1.85
AI2	Q0055	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85

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