RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA2Q08379 1002 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NSD2O96028 1365 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CABP2Q9NPB3 220 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTPRMP28827 1452 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POGKQ9P215 609 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ALKQ9UM73 1620 aa24.52■■□□□ 1.52
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MLECQ14165 292 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 APAF1O14727 1248 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRAM1Q96QH2 718 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLFN5Q08AF3 891 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CFAP53Q96M91 514 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXC-AS2-202ENST00000604081 E9PSI1 815 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTHFSP49914 203 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PP64 1363 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ABCC11Q96J66 1382 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZMYM3Q14202 1370 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLIN1O60240 522 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DLC1Q96QB1 1528 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RUNDC1Q96C34 613 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHPRHQ149N8 1683 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDK19Q9BWU1 502 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRBNQ96SW2 442 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MED14O60244 1454 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WWC1Q8IX03 1113 aa24.35■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNRQ92752 1358 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FYB1O15117 783 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYT1Q01538 1121 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CABP1Q9NZU7 370 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC27Q2M243 656 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR63Q8IWG1 891 aa24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SIRT1Q96EB6 747 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP1Q9C000 1473 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP7BP35670 1465 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.26■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEUROD2Q15784 382 aa24.25■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 METP08581 1390 aa24.24■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TECPR2O15040 1411 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MS4A1P11836 297 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCAR3O75815 825 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH16Q9H6N6 1097 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADGRB2O60241 1585 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDE3AQ14432 1141 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MSH5O43196 834 aa24.16■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.15■■□□□ 1.46
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