RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
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FCHO1-232ENST00000600209 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
FCHO1-232ENST00000600209 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.27■■■□□ 2.12
FCHO1-232ENST00000600209 DCCP43146 1447 aa28.24■■■□□ 2.11
FCHO1-232ENST00000600209 USP47Q96K76 1375 aa28.24■■■□□ 2.11
FCHO1-232ENST00000600209 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.23■■■□□ 2.11
FCHO1-232ENST00000600209 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.23■■■□□ 2.11
FCHO1-232ENST00000600209 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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FCHO1-232ENST00000600209 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.2■■■□□ 2.1
FCHO1-232ENST00000600209 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
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FCHO1-232ENST00000600209 TOM1O60784 492 aa28.19■■■□□ 2.1
FCHO1-232ENST00000600209 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.19■■■□□ 2.1
FCHO1-232ENST00000600209 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.19■■■□□ 2.1
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FCHO1-232ENST00000600209 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.06■■■□□ 2.08
FCHO1-232ENST00000600209 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.06■■■□□ 2.08
FCHO1-232ENST00000600209 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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FCHO1-232ENST00000600209 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.98■■■□□ 2.07
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FCHO1-232ENST00000600209 USP6P35125 1406 aa27.69■■■□□ 2.02
FCHO1-232ENST00000600209 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.69■■■□□ 2.02
FCHO1-232ENST00000600209 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
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FCHO1-232ENST00000600209 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.67■■■□□ 2.02
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