RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 NLRP1Q9C000 1473 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 CABP2Q9NPB3 220 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.47■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 NUDCQ9Y266 331 aa18.46■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.45■□□□□ 0.54
FCHO1-221ENST00000597512 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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FCHO1-221ENST00000597512 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
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FCHO1-221ENST00000597512 PTCH1Q13635 1447 aa18.18■□□□□ 0.5
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FCHO1-221ENST00000597512 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 RUNDC1Q96C34 613 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-221ENST00000597512 SLFN5Q08AF3 891 aa18.14■□□□□ 0.49
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