RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 CAPN15O75808 1086 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.18■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A0G2JS52 829 aa18.17■□□□□ 0.5
CAPNS1-209ENST00000590049 MYT1Q01538 1121 aa18.17■□□□□ 0.5
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CAPNS1-209ENST00000590049 NBPF14Q5TI25 921 aa18.17■□□□□ 0.5
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CAPNS1-209ENST00000590049 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.01■□□□□ 0.47
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CAPNS1-209ENST00000590049 ADGRL2O95490 1459 aa17.99■□□□□ 0.47
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CAPNS1-209ENST00000590049 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-209ENST00000590049 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-209ENST00000590049 KIF15Q9NS87 1388 aa17.97■□□□□ 0.47
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CAPNS1-209ENST00000590049 TNS4Q8IZW8 715 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-209ENST00000590049 MYOM1P52179 1685 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-209ENST00000590049 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CAPNS1-209ENST00000590049 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.94■□□□□ 0.46
CAPNS1-209ENST00000590049 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.94■□□□□ 0.46
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa17.89■□□□□ 0.45
CAPNS1-209ENST00000590049 CASZ1Q86V15 1759 aa17.88■□□□□ 0.45
CAPNS1-209ENST00000590049 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-209ENST00000590049 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-209ENST00000590049 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-209ENST00000590049 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.85■□□□□ 0.45
CAPNS1-209ENST00000590049 CABLES1Q8TDN4 633 aa17.83■□□□□ 0.44
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CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa17.82■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 APLP1P51693 650 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 BTG4Q9NY30 223 aa17.81■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP3K5Q99683 1374 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 NRAPQ86VF7 1730 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 ATP10DQ9P241 1426 aa17.79■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 ABCC5O15440 1437 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 PLEKHG5O94827 1062 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 APLP2Q06481 763 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.77■□□□□ 0.44
CAPNS1-209ENST00000590049 ROBO2Q9HCK4 1378 aa17.77■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 ARXQ96QS3 562 aa17.76■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 SGIP1Q9BQI5 828 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 MTFR1LQ9H019 292 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.73■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.73■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 PDE3BQ13370 1112 aa17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 HFM1A2PYH4 1435 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-209ENST00000590049 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
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