RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569773.1

GDE1-204, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 3

Gene GDE1, Length 739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-204ENST00000569773 NBPF3Q9H094 633 aa9.84□□□□□ -0.83
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GDE1-204ENST00000569773 HRO43593 1189 aa9.81□□□□□ -0.84
GDE1-204ENST00000569773 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
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GDE1-204ENST00000569773 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
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GDE1-204ENST00000569773 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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GDE1-204ENST00000569773 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.58□□□□□ -0.88
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