RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 RIMS2Q9UQ26 1411 aa8.66□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 MED14O60244 1454 aa8.65□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 PRAG1Q86YV5 1406 aa8.65□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.65□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.65□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GINS3-210ENST00000568468 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 KIF1BO60333 1816 aa8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 POTEIP0CG38 1075 aa8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 NBPF1Q3BBV0 1214 aa8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.64□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 MAP3K13O43283 966 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 LTKP29376 864 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 ZFYVE9O95405 1425 aa8.63□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 PYGBP11216 843 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 BCANQ96GW7 911 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 MYOM2P54296 1465 aa8.62□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 LTBP4Q8N2S1 1624 aa8.61□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 IQGAP1P46940 1657 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 RALGAPBQ86X10 1494 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 NRXN1Q9ULB1 1477 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 EID1Q9Y6B2 187 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 PIK3C2GO75747 1445 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 PPLO60437 1756 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 IFT172Q9UG01 1749 aa8.6□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
GINS3-210ENST00000568468 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 STK26Q9P289 416 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.58□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 IFNL1Q8IU54 200 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 CERKQ8TCT0 537 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 STAC3Q96MF2 364 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 USP47Q96K76 1375 aa8.57□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 TIE1P35590 1138 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 METP08581 1390 aa8.56□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ALKQ9UM73 1620 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 RGL2O15211 777 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 GPRASP1Q5JY77 1395 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.55□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 CPS1P31327 1500 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ADGRB1O14514 1584 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 DIP2AQ14689 1571 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 TRPC6Q9Y210 931 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 STRCP1A6NGW2 1772 aa8.53□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 NWD1Q149M9 1564 aa8.52□□□□□ -1.04
GINS3-210ENST00000568468 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 TBX22Q9Y458 520 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 PTPRUQ92729 1446 aa8.52□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 PIK3R4Q99570 1358 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 LRRC7Q96NW7 1537 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 KCNA6P17658 529 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 FBXO41Q8TF61 875 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 PRAM1Q96QH2 718 aa8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 LHX8Q68G74 356 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 SLC39A7Q92504 469 aa8.5□□□□□ -1.05
GINS3-210ENST00000568468 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
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