RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRS2Q9HD23 443 aa24.33■■□□□ 1.49
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.33■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.31■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPRUQ92729 1446 aa24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 RALBP1Q15311 655 aa24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
USP3-AS1-208ENST00000560962 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.26■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIK3R4Q99570 1358 aa24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 CABP2Q9NPB3 220 aa24.25■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.24■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.23■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTCH1Q13635 1447 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMC1Q8TDI8 760 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDK19Q9BWU1 502 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.22■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
USP3-AS1-208ENST00000560962 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRB2O60241 1585 aa24.17■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.17■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
USP3-AS1-208ENST00000560962 NLRP13Q86W25 1043 aa24.13■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.13■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 KCNA6P17658 529 aa24.12■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP32Q8NFA0 1604 aa24.11■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.1■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PP64 1363 aa24.09■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.08■■□□□ 1.45
USP3-AS1-208ENST00000560962 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 CABP1Q9NZU7 370 aa24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP7BP35670 1465 aa24.07■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.05■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.05■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPP2R1AP30153 589 aa24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.03■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.03■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 NSD2O96028 1365 aa24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 NWD1Q149M9 1564 aa24.02■■□□□ 1.44
USP3-AS1-208ENST00000560962 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
USP3-AS1-208ENST00000560962 HSPA2P54652 639 aa24■■□□□ 1.43
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.99■■□□□ 1.43
USP3-AS1-208ENST00000560962 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.98■■□□□ 1.43
USP3-AS1-208ENST00000560962 MORC1Q86VD1 984 aa23.96■■□□□ 1.43
USP3-AS1-208ENST00000560962 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.94■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.92■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.92■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 FYB1O15117 783 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 AKAP12Q02952 1782 aa23.91■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUTM2FA1L443 756 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITSN1Q15811 1721 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 STRCQ7RTU9 1775 aa23.9■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.89■■□□□ 1.42
USP3-AS1-208ENST00000560962 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.88■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.87■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACEP12821 1306 aa23.87■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 INSRP06213 1382 aa23.85■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 USP6P35125 1406 aa23.83■■□□□ 1.41
USP3-AS1-208ENST00000560962 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.83■■□□□ 1.4
USP3-AS1-208ENST00000560962 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.82■■□□□ 1.4
USP3-AS1-208ENST00000560962 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.81■■□□□ 1.4
USP3-AS1-208ENST00000560962 SSH2Q76I76 1423 aa23.8■■□□□ 1.4
USP3-AS1-208ENST00000560962 C14orf37Q86TY3 774 aa23.8■■□□□ 1.4
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