RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 STRCP1A6NGW2 1772 aa33.18■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.14■■■□□ 2.9
MEIS3-204ENST00000558555 WAPLQ7Z5K2 1190 aa33.14■■■□□ 2.89
MEIS3-204ENST00000558555 PTCH1Q13635 1447 aa33.13■■■□□ 2.89
MEIS3-204ENST00000558555 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.12■■■□□ 2.89
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa33.1■■■□□ 2.89
MEIS3-204ENST00000558555 EVC2Q86UK5 1308 aa33.1■■■□□ 2.89
MEIS3-204ENST00000558555 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
MEIS3-204ENST00000558555 KCNA6P17658 529 aa33.07■■■□□ 2.88
MEIS3-204ENST00000558555 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.04■■■□□ 2.88
MEIS3-204ENST00000558555 NWD1Q149M9 1564 aa33.03■■■□□ 2.88
MEIS3-204ENST00000558555 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.02■■■□□ 2.88
MEIS3-204ENST00000558555 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC7Q96NW7 1537 aa33■■■□□ 2.87
MEIS3-204ENST00000558555 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
MEIS3-204ENST00000558555 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRB2O60241 1585 aa32.96■■■□□ 2.87
MEIS3-204ENST00000558555 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
MEIS3-204ENST00000558555 CDK19Q9BWU1 502 aa32.94■■■□□ 2.86
MEIS3-204ENST00000558555 CABP2Q9NPB3 220 aa32.93■■■□□ 2.86
MEIS3-204ENST00000558555 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
MEIS3-204ENST00000558555 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
MEIS3-204ENST00000558555 MYOM1P52179 1685 aa32.91■■■□□ 2.86
MEIS3-204ENST00000558555 ATAD2Q6PL18 1390 aa32.9■■■□□ 2.86
MEIS3-204ENST00000558555 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP32.88■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.87■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 PIP4K2BP78356 416 aa32.85■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 TMC1Q8TDI8 760 aa32.85■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 TOM1O60784 492 aa32.85■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.84■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 NALCNQ8IZF0 1738 aa32.83■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 PANK3Q9H999 370 aa32.83■■■□□ 2.85
MEIS3-204ENST00000558555 C14orf37Q86TY3 774 aa32.82■■■□□ 2.84
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa32.82■■■□□ 2.84
MEIS3-204ENST00000558555 TMEM94Q12767 1356 aa32.8■■■□□ 2.84
MEIS3-204ENST00000558555 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa32.78■■■□□ 2.84
MEIS3-204ENST00000558555 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa32.78■■■□□ 2.84
MEIS3-204ENST00000558555 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.77■■■□□ 2.84
MEIS3-204ENST00000558555 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa32.76■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 ANP32CO43423 234 aa32.75■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 FMN2Q9NZ56 1722 aa32.74■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 ATP7BP35670 1465 aa32.74■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.73■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.71■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 TERF2IPQ9NYB0 399 aa32.71■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 CABP1Q9NZU7 370 aa32.71■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa32.71■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 ITSN1Q15811 1721 aa32.7■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 KNSTRNQ9Y448 316 aa32.7■■■□□ 2.83
MEIS3-204ENST00000558555 ANKARQ7Z5J8 1434 aa32.7■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.7■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 NUTM2FA1L443 756 aa32.69■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 MIER1Q8N108 512 aa32.68■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 C19orf44Q9H6X5 657 aa32.68■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.68■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 USP32Q8NFA0 1604 aa32.67■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 HSPA1LP34931 641 aa32.65■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
MEIS3-204ENST00000558555 A0A1W2PP64 1363 aa32.63■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 DCCP43146 1447 aa32.62■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 CARD14Q9BXL6 1004 aa32.62■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 MSH6P52701 1360 aa32.62■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 NSD3Q9BZ95 1437 aa32.61■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.61■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 ATF3P18847 181 aa32.6■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.59■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
MEIS3-204ENST00000558555 AKAP12Q02952 1782 aa32.57■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.56■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 CADPS2Q86UW7 1296 aa32.55■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa32.54■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.53■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 ACEP12821 1306 aa32.52■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.52■■■□□ 2.8
MEIS3-204ENST00000558555 RALBP1Q15311 655 aa32.51■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa32.51■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 PHF8Q9UPP1 1060 aa32.49■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa32.49■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 ESCO1Q5FWF5 840 aa32.48■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 C1orf167Q5SNV9 1468 aa32.48■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 MST1RQ04912 1400 aa32.47■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 SLAIN2Q9P270 581 aa32.46■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.46■■■□□ 2.79
MEIS3-204ENST00000558555 NSD2O96028 1365 aa32.45■■■□□ 2.79
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