RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547376.5

PTPRQ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,700 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-201ENST00000547376 KCNH8Q96L42 1107 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 CARNS1A5YM72 827 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 AP1G2O75843 785 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 CD46P15529 392 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 PBX2P40425 430 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 WASHC4Q2M389 1173 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 USP35Q9P2H5 1018 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRQ-201ENST00000547376 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 LILRB3O75022 631 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 GJA5P36382 358 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 QPCTQ16769 361 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 USP17L8P0C7I0 530 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 UNCXA6NJT0 531 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 ATG7O95352 703 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 SLC10A3P09131 477 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 SULF1Q8IWU6 871 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 ALG2Q9H553 416 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRQ-201ENST00000547376 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 TK2O00142 265 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 HRO43593 1189 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 NDUFV2P19404 249 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 VAC14Q08AM6 782 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 RDH13Q8NBN7 331 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 GPR37L1O60883 481 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 GCGRP47871 477 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 NBPF3Q9H094 633 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 CDCA8Q53HL2 280 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 HLA-CQ95604 372 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 UCN2Q96RP3 112 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRQ-201ENST00000547376 KDM4AO75164 1064 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 ERCC3P19447 782 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 SOX11P35716 441 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 HOXA2O43364 376 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 GUCA2AQ02747 115 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 PRR7Q8TB68 274 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 RNF40O75150 1001 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 CFHP08603 1231 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 SLF2Q8IX21 1173 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 FUT2Q10981 343 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 SEMA3FQ13275 785 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 SIRT1Q96EB6 747 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRQ-201ENST00000547376 USP46P62068 366 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms