RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MED14O60244 1454 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 EID1Q9Y6B2 187 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 POGKQ9P215 609 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.39■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.39■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.38■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 EVC2Q86UK5 1308 aa27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 TECPR2O15040 1411 aa27.35■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP13Q86W25 1043 aa27.34■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CABP2Q9NPB3 220 aa27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 CPS1P31327 1500 aa27.33■■□□□ 1.97
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRUQ92729 1446 aa27.32■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.31■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.3■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 TBX22Q9Y458 520 aa27.29■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 SIRT1Q96EB6 747 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.28■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 DIP2AQ14689 1571 aa27.27■■□□□ 1.96
PACSIN3-211ENST00000539589 CDK19Q9BWU1 502 aa27.25■■□□□ 1.95
PACSIN3-211ENST00000539589 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.23■■□□□ 1.95
PACSIN3-211ENST00000539589 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PACSIN3-211ENST00000539589 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.21■■□□□ 1.95
PACSIN3-211ENST00000539589 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.2■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.18■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.17■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.15■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.14■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 USP32Q8NFA0 1604 aa27.14■■□□□ 1.94
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRB2O60241 1585 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PTCH1Q13635 1447 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 A0A1W2PP64 1363 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.13■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDCQ9Y266 331 aa27.12■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3R4Q99570 1358 aa27.11■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 INSRP06213 1382 aa27.1■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 CABP1Q9NZU7 370 aa27.1■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP2R1AP30153 589 aa27.09■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNA6P17658 529 aa27.08■■□□□ 1.93
PACSIN3-211ENST00000539589 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP7BP35670 1465 aa27.04■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.03■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.02■■□□□ 1.92
PACSIN3-211ENST00000539589 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 AKAP12Q02952 1782 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 PDE3BQ13370 1112 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MORC1Q86VD1 984 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 NSD2O96028 1365 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-211ENST00000539589 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTM2FA1L443 756 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 ITSN1Q15811 1721 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA2P54652 639 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 FYB1O15117 783 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 NWD1Q149M9 1564 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-211ENST00000539589 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
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