RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520945.5

STAU2-209, Transcript of staufen double-stranded RNA binding protein 2, human

TSL 4

Gene STAU2, Length 472 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STAU2-209	ENST00000520945	EVI5	O60447	810 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	FAM161A	Q3B820	660 aa		4.99	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	XP32	Q5T750	250 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	NCOA2	Q15596	1464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	DGAT1	O75907	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	DMTN	Q08495	405 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	JPH4	Q96JJ6	628 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	WIZ	O95785	1651 aa		4.96	□□□□□ -1.61
STAU2-209	ENST00000520945	PTPRE	P23469	700 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	FOSB	P53539	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SYNJ1	O43426	1573 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	OFD1	O75665	1012 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CAMK2B	Q13554	666 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PKDCC	Q504Y2	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	POGK	Q9P215	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	MAP3K1	Q13233	1512 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	DPYSL4	O14531	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	FBXW7	Q969H0	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PHF14	O94880	888 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	BCAM	P50895	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	HS1BP3	Q53T59	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	LCE2C	Q5TA81	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	WBP1L	Q9NX94	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	UQCRH	P07919	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	MCM5	P33992	734 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	E2F4	Q16254	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	MCM4	P33991	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	TMC1	Q8TDI8	760 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	EPAS1	Q99814	870 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STAU2-209	ENST00000520945	ARAP1	Q96P48	1450 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms