RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520489.5

BIN3-208, Transcript of bridging integrator 3, human

TSL 2

Gene BIN3, Length 3,589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BIN3-208	ENST00000520489	NPAT	Q14207	1427 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489		E9PSI1	815 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.86	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	DLC1	Q96QB1	1528 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	NEO1	Q92859	1461 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BIN3-208	ENST00000520489	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	PTPRM	P28827	1452 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	ABCC11	Q96J66	1382 aa		13.77	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.77	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.77	□□□□□ -0.2
BIN3-208	ENST00000520489	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	PLIN1	O60240	522 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	FBLN2	P98095	1184 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	IL16	Q14005	1332 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	PIK3R4	Q99570	1358 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	AGL	P35573	1532 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	NFKBIB	Q15653	356 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	IGHD	P01880	384 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BIN3-208	ENST00000520489	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	GSE1	Q14687	1217 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	DDIT3	P35638	169 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	C3	P01024	1663 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	ATP7B	P35670	1465 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	NEFM	P07197	916 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.67	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	APAF1	O14727	1248 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.66	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	BCAR3	O75815	825 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.65	□□□□□ -0.22
BIN3-208	ENST00000520489	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.64	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	CPS1	P31327	1500 aa		13.63	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.62	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	FSD2	A1L4K1	749 aa		13.61	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	TECPR2	O15040	1411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
BIN3-208	ENST00000520489	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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