RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 EID1Q9Y6B2 187 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 ABCC11Q96J66 1382 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 DLC1Q96QB1 1528 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 SLIT1O75093 1534 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-228ENST00000515737 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 CDK19Q9BWU1 502 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.8■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 PPP2R1AP30153 589 aa22.79■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 SIRT1Q96EB6 747 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 TECPR2O15040 1411 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.77■■□□□ 1.24
SH3BP2-228ENST00000515737 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 MED14O60244 1454 aa22.76■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.75■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 TBX22Q9Y458 520 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 CPS1P31327 1500 aa22.73■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.72■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 A0A1W2PP64 1363 aa22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SH3BP2-228ENST00000515737 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 CABP1Q9NZU7 370 aa22.7■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 MORC1Q86VD1 984 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 PTPRUQ92729 1446 aa22.69■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 USP32Q8NFA0 1604 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.68■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.66■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 DIP2AQ14689 1571 aa22.64■■□□□ 1.22
SH3BP2-228ENST00000515737 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 NSD2O96028 1365 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.62■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 INSRP06213 1382 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 ATP7BP35670 1465 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.59■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 FYB1O15117 783 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.58■■□□□ 1.21
SH3BP2-228ENST00000515737 PTCH1Q13635 1447 aa22.58■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.57■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 PIK3R4Q99570 1358 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.56■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 ADGRB2O60241 1585 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 KCNA6P17658 529 aa22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 NUTM2FA1L443 756 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 MTHFSP49914 203 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-228ENST00000515737 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 NEFLP07196 543 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
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SH3BP2-228ENST00000515737 CFAP53Q96M91 514 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 NUDCQ9Y266 331 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-228ENST00000515737 ITSN1Q15811 1721 aa22.45■■□□□ 1.18
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SH3BP2-228ENST00000515737 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 ACEP12821 1306 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 NME9Q86XW9 330 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 PDE3BQ13370 1112 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 SHPRHQ149N8 1683 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SH3BP2-228ENST00000515737 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.39■■□□□ 1.17
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