RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.26□□□□□ -0.45
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLCH2O75038 1416 aa12.26□□□□□ -0.45
MSC-AS1-202ENST00000512290 NCOA1Q15788 1441 aa12.26□□□□□ -0.45
MSC-AS1-202ENST00000512290 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
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MSC-AS1-202ENST00000512290 CFAP44Q96MT7 982 aa12.25□□□□□ -0.45
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SAMD9Q5K651 1589 aa12.17□□□□□ -0.46
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MSC-AS1-202ENST00000512290 WDR70Q9NW82 654 aa12.16□□□□□ -0.46
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MSC-AS1-202ENST00000512290 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.15□□□□□ -0.46
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MSC-AS1-202ENST00000512290 E2F4Q16254 413 aa12.13□□□□□ -0.47
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MSC-AS1-202ENST00000512290 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.13□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTPRKQ15262 1439 aa12.12□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 ANKLE2Q86XL3 938 aa12.12□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.11□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 CLIP1P30622 1438 aa12.11□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.1□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 NBR1Q14596 966 aa12.1□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 AGLP35573 1532 aa12.1□□□□□ -0.47
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MSC-AS1-202ENST00000512290 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.09□□□□□ -0.47
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MSC-AS1-202ENST00000512290 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.08□□□□□ -0.47
MSC-AS1-202ENST00000512290 ANKK1Q8NFD2 765 aa12.08□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLA2R1Q13018 1463 aa12.08□□□□□ -0.48
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MSC-AS1-202ENST00000512290 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM5CP41229 1560 aa12.06□□□□□ -0.48
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCA6Q8N139 1617 aa12.06□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 REREQ9P2R6 1566 aa12.05□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.05□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEAQ6S8J7 498 aa12.05□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIF14Q15058 1648 aa12.04□□□□□ -0.48
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
MSC-AS1-202ENST00000512290 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.02□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 BCAMP50895 628 aa12.02□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 FMN1Q68DA7 1419 aa12.01□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 MROH2AA6NES4 1674 aa12□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 A2ML1A8K2U0 1454 aa12□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.99□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 PACS2Q86VP3 889 aa11.99□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.98□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 TNRQ92752 1358 aa11.98□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.97□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 IFFO2Q5TF58 517 aa11.97□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.97□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 TSKSQ9UJT2 592 aa11.96□□□□□ -0.49
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIF3BO15066 747 aa11.95□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRIM52Q96A61 297 aa11.95□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 A2MP01023 1474 aa11.95□□□□□ -0.5
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.94□□□□□ -0.5
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