RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP3K9	P80192	1104 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		9.42	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	NCOA2	Q15596	1464 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0G2JS52	829 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		9.41	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	UACA	Q9BZF9	1416 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		9.4	□□□□□ -0.9
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP10B	O94823	1461 aa		9.4	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	MIA2	Q96PC5	1412 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	COL9A1	P20849	921 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCC2	Q92887	1545 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		9.39	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXW7	Q969H0	707 aa		9.38	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF14	O94880	888 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	PROX2	Q3B8N5	592 aa		9.37	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMK2B	Q13554	666 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	ZMYND15	Q9H091	742 aa		9.36	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		9.35	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		9.34	□□□□□ -0.91
FBXO38-208	ENST00000504971	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	AAMP	Q13685	434 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF14	Q15058	1648 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		9.33	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	PTMS	P20962	102 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		9.32	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	EPAS1	Q99814	870 aa		9.31	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	RAD21	O60216	631 aa		9.3	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		9.3	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	9.3	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	BCAM	P50895	628 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF592	Q92610	1267 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	AKNA	Q7Z591	1439 aa		9.29	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ARID3C	A6NKF2	412 aa		9.28	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
FBXO38-208	ENST00000504971	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		9.27	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	HFM1	A2PYH4	1435 aa		9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	DPYSL4	O14531	572 aa		9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	NECTIN2	Q92692	538 aa		9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		9.26	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	ROCK1	Q13464	1354 aa		9.25	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	PREX2	Q70Z35	1606 aa		9.25	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		9.25	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPRK	Q15262	1439 aa		9.24	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		9.24	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	WBP1L	Q9NX94	342 aa		9.24	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	9.24	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	DAPK1	P53355	1430 aa		9.23	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		9.23	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		9.23	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		9.23	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCC5	O15440	1437 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCH2	O75038	1416 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	NAIP	Q13075	1403 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		9.22	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	ADGRL2	O95490	1459 aa		9.21	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		9.21	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		9.21	□□□□□ -0.93
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		9.21	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms