RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499392.1

LRAT-202, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LRAT, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-202ENST00000499392 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.73□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.73□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.73□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.72□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.72□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 NACADO15069 1562 aa8.72□□□□□ -1.01
LRAT-202ENST00000499392 Q3C1V9 767 aa8.71□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 TLL1O43897 1013 aa8.7□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.7□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 ADH1BP00325 375 aa8.69□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 SPSB2Q99619 263 aa8.69□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 LILRB3O75022 631 aa8.68□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 QPCTQ16769 361 aa8.67□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 HRCP23327 699 aa8.66□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 MSS51Q4VC12 460 aa8.66□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 RETREG3Q86VR2 466 aa8.66□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.65□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 MTMR2Q13614 643 aa8.65□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.65□□□□□ -1.02
LRAT-202ENST00000499392 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.64□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 C6orf229H3BNL8 230 aa8.64□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.64□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.64□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 A0A0G2JS52 829 aa8.63□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 MMP16P51512 607 aa8.63□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.63□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.63□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.63□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 CFAP99D6REC4 459 aa8.62□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 S1PR4O95977 384 aa8.62□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.62□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.62□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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LRAT-202ENST00000499392 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 RNF223E7ERA6 249 aa8.6□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 DESI1Q6ICB0 168 aa8.6□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 JUNDP17535 347 aa8.59□□□□□ -1.03
LRAT-202ENST00000499392 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.58□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 GGCXP38435 758 aa8.57□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.57□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 RGS20O76081 388 aa8.56□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 RFC5P40937 340 aa8.56□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 LYPD8Q6UX82 237 aa8.55□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.54□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 PTPRNQ16849 979 aa8.53□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LRAT-202ENST00000499392 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.52□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.51□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.51□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.5□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.5□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.5□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 AP1G2O75843 785 aa8.48□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 BANK1Q8NDB2 785 aa8.48□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 RPIAP49247 311 aa8.47□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 KCNH2Q12809 1159 aa8.47□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.47□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 TSC1Q92574 1164 aa8.47□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.46□□□□□ -1.05
LRAT-202ENST00000499392 USP17L8P0C7I0 530 aa8.46□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 SLC19A1P41440 591 aa8.46□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.46□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 SCRIBQ14160 1630 aa8.46□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.45□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 MAP10Q9P2G4 905 aa8.45□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 SOCS7O14512 581 aa8.44□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 SPRYD7Q5W111 196 aa8.44□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.43□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.43□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.43□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 SNRKQ9NRH2 765 aa8.43□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.43□□□□□ -1.06
LRAT-202ENST00000499392 TRIM32Q13049 653 aa8.42□□□□□ -1.06
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