RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.3■■■□□ 2.28
USP13-202ENST00000482333 ABCC11Q96J66 1382 aa29.29■■■□□ 2.28
USP13-202ENST00000482333 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.27■■■□□ 2.28
USP13-202ENST00000482333 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
USP13-202ENST00000482333 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.26■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.26■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 USP32Q8NFA0 1604 aa29.25■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.25■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 LTKP29376 864 aa29.24■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.22■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 INSRP06213 1382 aa29.21■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.21■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.21■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 BCANQ96GW7 911 aa29.21■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.21■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.21■■■□□ 2.27
USP13-202ENST00000482333 FKBP8Q14318 412 aa29.2■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 CDK19Q9BWU1 502 aa29.2■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 SLIT1O75093 1534 aa29.19■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.19■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 TECPR2O15040 1411 aa29.18■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.18■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 A0A1W2PP64 1363 aa29.16■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.16■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 CPS1P31327 1500 aa29.16■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 NEFLP07196 543 aa29.15■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 ADAMTS8Q9UP79 889 aa29.15■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.15■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.15■■■□□ 2.26
USP13-202ENST00000482333 MORC1Q86VD1 984 aa29.13■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 MED14O60244 1454 aa29.13■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 SIRT1Q96EB6 747 aa29.13■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 EID1Q9Y6B2 187 aa29.13■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.1■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 NSD2O96028 1365 aa29.09■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.08■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 NUDCQ9Y266 331 aa29.08■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 CABP1Q9NZU7 370 aa29.08■■■□□ 2.25
USP13-202ENST00000482333 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.07■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.07■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 PTPRUQ92729 1446 aa29.04■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
USP13-202ENST00000482333 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 TBX22Q9Y458 520 aa29■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 ATP7BP35670 1465 aa29■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.98■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 FYB1O15117 783 aa28.97■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.97■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 SHPRHQ149N8 1683 aa28.97■■■□□ 2.23
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USP13-202ENST00000482333 PDE3BQ13370 1112 aa28.96■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.96■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 ADGRB2O60241 1585 aa28.95■■■□□ 2.23
USP13-202ENST00000482333 MTHFSP49914 203 aa28.95■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.94■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.93■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.92■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.92■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.92■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.9■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.9■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.89■■■□□ 2.22
USP13-202ENST00000482333 PTCH1Q13635 1447 aa28.89■■■□□ 2.21
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USP13-202ENST00000482333 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.87■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.211e-6■■■■□ 20.1
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USP13-202ENST00000482333 ZNF521Q96K83 1311 aa28.84■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.84■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 AKAP12Q02952 1782 aa28.83■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 APAF1O14727 1248 aa28.83■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.83■■■□□ 2.21
USP13-202ENST00000482333 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.82■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 ITSN1Q15811 1721 aa28.82■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.8■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 PIK3R4Q99570 1358 aa28.79■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 NUTM2FA1L443 756 aa28.77■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 KCNA6P17658 529 aa28.77■■■□□ 2.2
USP13-202ENST00000482333 NME9Q86XW9 330 aa28.76■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.75■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
USP13-202ENST00000482333 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.73■■■□□ 2.19
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