RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM29Q14134 588 aa20.85■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.85■□□□□ 0.93
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.84■□□□□ 0.93
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PANK1Q8TE04 598 aa20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RUNDC1Q96C34 613 aa20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ROCK1Q13464 1354 aa20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.82■□□□□ 0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPLX1O14810 134 aa20.81■□□□□ 0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIAM1Q13009 1591 aa20.78■□□□□ 0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF214Q8ND24 703 aa20.78■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEFQ10587 303 aa20.77■□□□□ 0.92
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AAMPQ13685 434 aa20.77■□□□□ 0.92
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP7D2Q96T17 732 aa20.75■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.72■□□□□ 0.91
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERC2O15083 957 aa20.7■□□□□ 0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.69■□□□□ 0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CABP2Q9NPB3 220 aa20.68■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.68■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD109Q6YHK3 1445 aa20.68■□□□□ 0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.67■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC27Q2M243 656 aa20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WWC1Q8IX03 1113 aa20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMOX1P09601 288 aa20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDILTQ8N807 584 aa20.66■□□□□ 0.9
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MBD3O95983 291 aa20.65■□□□□ 0.9
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