RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.65■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.64■■□□□ 1.7
SYF2-204ENST00000476231 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.64■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 METP08581 1390 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.63■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.62■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 EID1Q9Y6B2 187 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 TECPR2O15040 1411 aa25.61■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 SIRT1Q96EB6 747 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 CABP2Q9NPB3 220 aa25.6■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 USP32Q8NFA0 1604 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 LTKP29376 864 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.59■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.58■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SYF2-204ENST00000476231 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.58■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 CPS1P31327 1500 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 PPP2R1AP30153 589 aa25.57■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 MED14O60244 1454 aa25.55■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.54■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 INSRP06213 1382 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 CDK19Q9BWU1 502 aa25.53■■□□□ 1.68
SYF2-204ENST00000476231 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.5■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 DIP2AQ14689 1571 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.49■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 NSD2O96028 1365 aa25.48■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 NUDCQ9Y266 331 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 TBX22Q9Y458 520 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.47■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 A0A1W2PP64 1363 aa25.46■■□□□ 1.67
SYF2-204ENST00000476231 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.44■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 MORC1Q86VD1 984 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.43■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 MYT1Q01538 1121 aa25.42■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 PTPRUQ92729 1446 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 ADGRB2O60241 1585 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 ATP7BP35670 1465 aa25.41■■□□□ 1.66
SYF2-204ENST00000476231 CABP1Q9NZU7 370 aa25.38■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 PTCH1Q13635 1447 aa25.37■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 PIK3R4Q99570 1358 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.35■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.34■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 PDE3BQ13370 1112 aa25.33■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.33■■□□□ 1.65
SYF2-204ENST00000476231 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.31■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.3■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.29■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 FYB1O15117 783 aa25.28■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SYF2-204ENST00000476231 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 ITSN1Q15811 1721 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.25■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 AKAP12Q02952 1782 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 MTHFSP49914 203 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 CFAP53Q96M91 514 aa25.24■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 SHPRHQ149N8 1683 aa25.23■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SYF2-204ENST00000476231 KCNA6P17658 529 aa25.19■■□□□ 1.62
SYF2-204ENST00000476231 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SYF2-204ENST00000476231 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-204ENST00000476231 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.18■■□□□ 1.62
SYF2-204ENST00000476231 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
SYF2-204ENST00000476231 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.14■■□□□ 1.61
SYF2-204ENST00000476231 NGEFQ8N5V2 710 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64 ms