RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 MRS2Q9HD23 443 aa22.3■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.3■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 TBX22Q9Y458 520 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.29■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.28■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.28■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.27■■□□□ 1.16
USP20-204ENST00000472108 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.27■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 CABP2Q9NPB3 220 aa22.27■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 TMC1Q8TDI8 760 aa22.26■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.26■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 CPS1P31327 1500 aa22.25■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.24■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 DIP2AQ14689 1571 aa22.24■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.24■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 CDK19Q9BWU1 502 aa22.23■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.23■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.23■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
USP20-204ENST00000472108 PTPRUQ92729 1446 aa22.2■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 NLRP13Q86W25 1043 aa22.2■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.2■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.18■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.18■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 PIK3R4Q99570 1358 aa22.17■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.17■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.15■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP20-204ENST00000472108 PTCH1Q13635 1447 aa22.13■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.12■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 PPP2R1AP30153 589 aa22.1■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 CABP1Q9NZU7 370 aa22.1■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.1■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 USP32Q8NFA0 1604 aa22.1■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 A0A1W2PP64 1363 aa22.1■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 ADGRB2O60241 1585 aa22.09■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.08■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
USP20-204ENST00000472108 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.06■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 KCNA6P17658 529 aa22.06■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.06■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 NSD2O96028 1365 aa22.05■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 MYT1Q01538 1121 aa22.05■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 ATP7BP35670 1465 aa22.05■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.04■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 MORC1Q86VD1 984 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.03■■□□□ 1.12
USP20-204ENST00000472108 PRR36Q9H6K5 1346 aa22■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 FYB1O15117 783 aa21.97■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 INSRP06213 1382 aa21.96■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.96■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.96■■□□□ 1.11
USP20-204ENST00000472108 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.95■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.93■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.92■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 NUTM2FA1L443 756 aa21.92■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 HSPA2P54652 639 aa21.9■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 AKAP12Q02952 1782 aa21.9■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 NWD1Q149M9 1564 aa21.89■■□□□ 1.1
USP20-204ENST00000472108 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.89■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.89■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 ACEP12821 1306 aa21.89■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.89■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 MON2Q7Z3U7 1717 aa21.88■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.88■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 MTHFSP49914 203 aa21.87■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 ITSN1Q15811 1721 aa21.87■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.87■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.85■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.85■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.85■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 CFAP53Q96M91 514 aa21.83■■□□□ 1.09
USP20-204ENST00000472108 NME9Q86XW9 330 aa21.83■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 USP6P35125 1406 aa21.82■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.82■■□□□ 1.08
USP20-204ENST00000472108 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.82■■□□□ 1.08
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