RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461214.1

COL5A3-202, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL5A3, Length 828 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-202ENST00000461214 DLC1Q96QB1 1528 aa20.56■□□□□ 0.88
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COL5A3-202ENST00000461214 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
COL5A3-202ENST00000461214 TBX22Q9Y458 520 aa20.53■□□□□ 0.88
COL5A3-202ENST00000461214 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
COL5A3-202ENST00000461214 SHPRHQ149N8 1683 aa20.53■□□□□ 0.88
COL5A3-202ENST00000461214 TECPR2O15040 1411 aa20.53■□□□□ 0.88
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COL5A3-202ENST00000461214 METP08581 1390 aa20.49■□□□□ 0.87
COL5A3-202ENST00000461214 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.49■□□□□ 0.87
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COL5A3-202ENST00000461214 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.44■□□□□ 0.86
COL5A3-202ENST00000461214 ABCC11Q96J66 1382 aa20.44■□□□□ 0.86
COL5A3-202ENST00000461214 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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COL5A3-202ENST00000461214 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.42■□□□□ 0.86
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COL5A3-202ENST00000461214 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20.38■□□□□ 0.85
COL5A3-202ENST00000461214 FMN2Q9NZ56 1722 aa20.38■□□□□ 0.85
COL5A3-202ENST00000461214 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.36■□□□□ 0.85
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COL5A3-202ENST00000461214 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.35■□□□□ 0.85
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COL5A3-202ENST00000461214 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.32■□□□□ 0.84
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COL5A3-202ENST00000461214 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.31■□□□□ 0.84
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COL5A3-202ENST00000461214 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa20.27■□□□□ 0.84
COL5A3-202ENST00000461214 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.27■□□□□ 0.83
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COL5A3-202ENST00000461214 SLC24A1O60721 1099 aa20.24■□□□□ 0.83
COL5A3-202ENST00000461214 POGKQ9P215 609 aa20.24■□□□□ 0.83
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COL5A3-202ENST00000461214 AKAP12Q02952 1782 aa20.21■□□□□ 0.83
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COL5A3-202ENST00000461214 CCDC125Q86Z20 511 aa20.19■□□□□ 0.82
COL5A3-202ENST00000461214 TESK2Q96S53 571 aa20.19■□□□□ 0.82
COL5A3-202ENST00000461214 ANKARQ7Z5J8 1434 aa20.18■□□□□ 0.82
COL5A3-202ENST00000461214 ATP7BP35670 1465 aa20.18■□□□□ 0.82
COL5A3-202ENST00000461214 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.16■□□□□ 0.82
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COL5A3-202ENST00000461214 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
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COL5A3-202ENST00000461214 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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COL5A3-202ENST00000461214 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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COL5A3-202ENST00000461214 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.09■□□□□ 0.81
COL5A3-202ENST00000461214 ORAI2Q96SN7 254 aa20.09■□□□□ 0.81
COL5A3-202ENST00000461214 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
COL5A3-202ENST00000461214 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.08■□□□□ 0.81
COL5A3-202ENST00000461214 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.08■□□□□ 0.8
COL5A3-202ENST00000461214 EP400Q96L91 3159 aa20.07■□□□□ 0.8
COL5A3-202ENST00000461214 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
COL5A3-202ENST00000461214 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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COL5A3-202ENST00000461214 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
COL5A3-202ENST00000461214 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.05■□□□□ 0.8
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