RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP2R1AP30153 589 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 ALKQ9UM73 1620 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 EVC2Q86UK5 1308 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE3BQ13370 1112 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 DLC1Q96QB1 1528 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP2-202ENST00000435136 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.93■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 SLIT1O75093 1534 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 EID1Q9Y6B2 187 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 MED14O60244 1454 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-202ENST00000435136 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 NSD2O96028 1365 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 BCANQ96GW7 911 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-202ENST00000435136 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CERKQ8TCT0 537 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCC11Q96J66 1382 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAM1Q96QH2 718 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 STK26Q9P289 416 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 NGEFQ8N5V2 710 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 POGKQ9P215 609 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TECPR2O15040 1411 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 MORC1Q86VD1 984 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SIRT1Q96EB6 747 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CABP2Q9NPB3 220 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SHPRHQ149N8 1683 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 CPS1P31327 1500 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PP64 1363 aa24.71■■□□□ 1.55
SH3BP2-202ENST00000435136 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.7■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF521Q96K83 1311 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP7BP35670 1465 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 TBX22Q9Y458 520 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK19Q9BWU1 502 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2-202ENST00000435136 METP08581 1390 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CFAP53Q96M91 514 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNA6P17658 529 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXO41Q8TF61 875 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 ADGRB2O60241 1585 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA2Q08379 1002 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 DIP2AQ14689 1571 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 MTHFSP49914 203 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRUQ92729 1446 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 SLFN5Q08AF3 891 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2-202ENST00000435136 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms