RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 USP32Q8NFA0 1604 aa29.11■■■□□ 2.25
SH3BP5-204ENST00000412806 METP08581 1390 aa29.11■■■□□ 2.25
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SH3BP5-204ENST00000412806 ABCC11Q96J66 1382 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP5-204ENST00000412806 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.06■■■□□ 2.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.04■■■□□ 2.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.01■■■□□ 2.24
SH3BP5-204ENST00000412806 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.01■■■□□ 2.24
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SH3BP5-204ENST00000412806 CDK19Q9BWU1 502 aa28.99■■■□□ 2.23
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SH3BP5-204ENST00000412806 MED14O60244 1454 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1W2PP64 1363 aa28.96■■■□□ 2.23
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SH3BP5-204ENST00000412806 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.94■■■□□ 2.22
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SH3BP5-204ENST00000412806 NSD2O96028 1365 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SH3BP5-204ENST00000412806 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
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SH3BP5-204ENST00000412806 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 ATP7BP35670 1465 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP5-204ENST00000412806 ADGRB2O60241 1585 aa28.82■■■□□ 2.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.77■■■□□ 2.2
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SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP12Q02952 1782 aa28.76■■■□□ 2.19
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SH3BP5-204ENST00000412806 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.72■■■□□ 2.19
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SH3BP5-204ENST00000412806 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
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SH3BP5-204ENST00000412806 CFAP53Q96M91 514 aa28.64■■■□□ 2.18
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SH3BP5-204ENST00000412806 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF521Q96K83 1311 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 APAF1O14727 1248 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
SH3BP5-204ENST00000412806 NUTM2FA1L443 756 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNA6P17658 529 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP5-204ENST00000412806 NME9Q86XW9 330 aa28.55■■■□□ 2.16
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