RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409937.1

CNGA3-204, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNGA3, Length 2,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-204ENST00000409937 SHPRHQ149N8 1683 aa18.2■□□□□ 0.5
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CNGA3-204ENST00000409937 MTHFSP49914 203 aa18.19■□□□□ 0.5
CNGA3-204ENST00000409937 USP35Q9P2H5 1018 aa18.19■□□□□ 0.5
CNGA3-204ENST00000409937 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CNGA3-204ENST00000409937 ASXL2Q76L83 1435 aa18.18■□□□□ 0.5
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CNGA3-204ENST00000409937 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
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CNGA3-204ENST00000409937 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18■□□□□ 0.47
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CNGA3-204ENST00000409937 MYH16Q9H6N6 1097 aa17.98■□□□□ 0.47
CNGA3-204ENST00000409937 IDI1Q13907 227 aa17.98■□□□□ 0.47
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CNGA3-204ENST00000409937 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.97■□□□□ 0.47
CNGA3-204ENST00000409937 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa17.97■□□□□ 0.47
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CNGA3-204ENST00000409937 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.97■□□□□ 0.47
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM27P14373 513 aa17.96■□□□□ 0.47
CNGA3-204ENST00000409937 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa17.96■□□□□ 0.47
CNGA3-204ENST00000409937 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa17.96■□□□□ 0.47
CNGA3-204ENST00000409937 TRIM35Q9UPQ4 493 aa17.96■□□□□ 0.47
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CNGA3-204ENST00000409937 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 CCDC27Q2M243 656 aa17.95■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 VGFO15240 615 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 TBC1D32Q96NH3 1257 aa17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 PRAM1Q96QH2 718 aa17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-204ENST00000409937 MYO5BQ9ULV0 1848 aa17.94■□□□□ 0.46
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