RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397149.3

SMU1-201, Transcript of SMU1, DNA replication regulator and spliceosomal factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMU1, Length 7,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1-201ENST00000397149 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
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SMU1-201ENST00000397149 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SMU1-201ENST00000397149 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMU1-201ENST00000397149 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.66□□□□□ -0.06
SMU1-201ENST00000397149 LRRCC1Q9C099 1032 aa14.65□□□□□ -0.06
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SMU1-201ENST00000397149 CA8P35219 290 aa14.64□□□□□ -0.07
SMU1-201ENST00000397149 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.64□□□□□ -0.07
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