RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 SLFN5Q08AF3 891 aa11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 SMC5Q8IY18 1101 aa11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 NGEFQ8N5V2 710 aa11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF445P59923 1031 aa11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.76□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 NEUROD2Q15784 382 aa11.76□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 APAF1O14727 1248 aa11.76□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.75□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 TMX1Q9H3N1 280 aa11.75□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.75□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 GRIN2BQ13224 1484 aa11.75□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.74□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 DDIT3P35638 169 aa11.74□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 RBM25P49756 843 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 OGFRQ9NZT2 677 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 ADAMTS12P58397 1594 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 CAPN2P17655 700 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 MLECQ14165 292 aa11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 PDE3AQ14432 1141 aa11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 CHD1O14646 1710 aa11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.72□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
TMOD1-203ENST00000395211 CUL7Q14999 1698 aa11.71□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SLFN14P0C7P3 912 aa11.71□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 RLBP1P12271 317 aa11.71□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.71□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PKP1Q13835 747 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 USP25Q9UHP3 1055 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 KDM6BO15054 1643 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 FEZ1Q99689 392 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SNX21Q969T3 373 aa11.7□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.546e-6■■□□□ 12.7
TMOD1-203ENST00000395211 GPT2Q8TD30 523 aa11.69□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.69□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 WWC1Q8IX03 1113 aa11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 CNPY4Q8N129 248 aa11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SYNJ2O15056 1496 aa11.68□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PKD2Q13563 968 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 TERF2Q15554 542 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 TSPY26PQ9H489 355 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 LNPKQ9C0E8 428 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.67□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 AK9Q5TCS8 1911 aa11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SPC24Q8NBT2 197 aa11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 TOMM22Q9NS69 142 aa11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 KCNG1Q9UIX4 513 aa11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 KIF16BQ96L93 1317 aa11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 EP400NLQ6ZTU2 488 aa11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 HECW1Q76N89 1606 aa11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 PRR29P0C7W0 189 aa11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 SLC20A2Q08357 652 aa11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 ST7Q9NRC1 585 aa11.65□□□□□ -0.54
TMOD1-203ENST00000395211 NUCB2P80303 420 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 ANKRD7Q92527 254 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 ADCY5O95622 1261 aa11.64□□□□□ -0.55
TMOD1-203ENST00000395211 GPATCH11Q8N954 259 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms