RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 LTKP29376 864 aa32.82■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.82■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 NINLQ9Y2I6 1382 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 TXNDC2Q86VQ3 553 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 BCANQ96GW7 911 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa32.79■■■□□ 2.84
SERF1B-201ENST00000380750 PPP2R1AP30153 589 aa32.78■■■□□ 2.84
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SERF1B-201ENST00000380750 WAPLQ7Z5K2 1190 aa32.76■■■□□ 2.83
SERF1B-201ENST00000380750 SIRT1Q96EB6 747 aa32.76■■■□□ 2.83
SERF1B-201ENST00000380750 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.75■■■□□ 2.83
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SERF1B-201ENST00000380750 USP32Q8NFA0 1604 aa32.73■■■□□ 2.83
SERF1B-201ENST00000380750 CDK19Q9BWU1 502 aa32.71■■■□□ 2.83
SERF1B-201ENST00000380750 CPS1P31327 1500 aa32.71■■■□□ 2.83
SERF1B-201ENST00000380750 MED14O60244 1454 aa32.71■■■□□ 2.83
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SERF1B-201ENST00000380750 INSRP06213 1382 aa32.68■■■□□ 2.82
SERF1B-201ENST00000380750 CGNL1Q0VF96 1302 aa32.66■■■□□ 2.82
SERF1B-201ENST00000380750 A0A1W2PP64 1363 aa32.64■■■□□ 2.82
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SERF1B-201ENST00000380750 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.61■■■□□ 2.81
SERF1B-201ENST00000380750 TBX22Q9Y458 520 aa32.61■■■□□ 2.81
SERF1B-201ENST00000380750 CD163L1Q9NR16 1453 aa32.6■■■□□ 2.81
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SERF1B-201ENST00000380750 WASLO00401 505 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
SERF1B-201ENST00000380750 MORC1Q86VD1 984 aa32.59■■■□□ 2.81
SERF1B-201ENST00000380750 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.81
SERF1B-201ENST00000380750 PTPRUQ92729 1446 aa32.56■■■□□ 2.8
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
SERF1B-201ENST00000380750 CABP1Q9NZU7 370 aa32.54■■■□□ 2.8
SERF1B-201ENST00000380750 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
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SERF1B-201ENST00000380750 ATP7BP35670 1465 aa32.52■■■□□ 2.8
SERF1B-201ENST00000380750 ADAMTS8Q9UP79 889 aa32.51■■■□□ 2.79
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SERF1B-201ENST00000380750 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP32.44■■■□□ 2.78
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SERF1B-201ENST00000380750 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.42■■■□□ 2.78
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SERF1B-201ENST00000380750 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.36■■■□□ 2.77
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SERF1B-201ENST00000380750 PDE3BQ13370 1112 aa32.35■■■□□ 2.77
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SERF1B-201ENST00000380750 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
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SERF1B-201ENST00000380750 ACEP12821 1306 aa32.18■■■□□ 2.74
SERF1B-201ENST00000380750 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.18■■■□□ 2.74
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF521Q96K83 1311 aa32.17■■■□□ 2.74
SERF1B-201ENST00000380750 NME9Q86XW9 330 aa32.17■■■□□ 2.74
SERF1B-201ENST00000380750 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
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SERF1B-201ENST00000380750 NGEFQ8N5V2 710 aa32.16■■■□□ 2.74
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