RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ARAP1Q96P48 1450 aa22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PDE3AQ14432 1141 aa22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 NEK4P51957 841 aa22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPRGP23470 1445 aa22.42■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MARCH6O60337 910 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 APPP05067 770 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 EVC2Q86UK5 1308 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 H0YHG0 523 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SDF4Q9BRK5 362 aa22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MPNDQ8N594 471 aa22.4■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.39■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 SPC24Q8NBT2 197 aa22.39■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC27Q2M243 656 aa22.39■■□□□ 1.18
AMIGO1-202ENST00000369864 MCM2P49736 904 aa22.39■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CDR1P51861 262 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 COG3Q96JB2 828 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FOSBP53539 338 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 GNAI1P63096 354 aa22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 FIBPO43427 364 aa22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 PDILTQ8N807 584 aa22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 BCAR3O75815 825 aa22.34■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 NUTM2FA1L443 756 aa22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 ERC2O15083 957 aa22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CUX1P39880 1505 aa22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
AMIGO1-202ENST00000369864 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.33■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.33■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NCOA2Q15596 1464 aa22.33■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC184Q52MB2 194 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NECTIN2Q92692 538 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 OLFM4Q6UX06 510 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 MIA2Q96PC5 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 SYNJ1O43426 1573 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 SMC2O95347 1197 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CCP110O43303 1012 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 KINO60870 393 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC192P0DO97 292 aa22.3■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TRDNQ13061 729 aa22.3■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCP20941 246 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NCAPD3P42695 1498 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 TEFQ10587 303 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 GCC1Q96CN9 775 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.29■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP2R1AP30153 589 aa22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.28■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 PSMA5P28066 241 aa22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 VPS53Q5VIR6 699 aa22.27■■□□□ 1.16
AMIGO1-202ENST00000369864 CAGE1Q8TC20 777 aa22.26■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF3Q5VWG9 929 aa22.26■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.26■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 DCTN1Q14203 1278 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.24■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 CNTROBQ8N137 903 aa22.23■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 HMOX1P09601 288 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 MTHFSP49914 203 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.22■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 PRXQ9BXM0 1461 aa22.21■■□□□ 1.15
AMIGO1-202ENST00000369864 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms