RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CASQ1-201ENST00000368078 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.61■□□□□ 0.89
CASQ1-201ENST00000368078 HSPA2P54652 639 aa20.61■□□□□ 0.89
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CASQ1-201ENST00000368078 MTHFSP49914 203 aa20.58■□□□□ 0.88
CASQ1-201ENST00000368078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
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CASQ1-201ENST00000368078 FBLN1P23142 703 aa20.56■□□□□ 0.88
CASQ1-201ENST00000368078 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
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CASQ1-201ENST00000368078 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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