RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPG7Q9UQ90 795 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYSRT1A8MQ03 144 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NELL1Q92832 810 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MEGF10Q96KG7 1140 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AXIN2Q9Y2T1 843 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MPLKIPQ8TAP9 179 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNN2Q9H2S1 579 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDH10Q9P2E7 1040 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TLL2Q9Y6L7 1015 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM186AA6NE01 2351 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNK17Q96T54 332 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMR3AQ99954 134 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UTS2RQ9UKP6 389 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MTORP42345 2549 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOTCH4Q99466 2003 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TPRP12270 2363 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT33BQ14525 404 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSGA10IPQ3SY00 556 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF687Q8N1G0 1237 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC61Q9Y6R9 512 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SOBPA7XYQ1 873 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FHL3Q13643 280 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF398Q8TD17 642 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCSK5Q92824 1860 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRWD3Q6RI45 1802 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC85CA6NKD9 419 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM65Q6PJ69 517 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TESMINQ9Y4I5 508 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NTN1O95631 604 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EML3Q32P44 896 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SGPP1Q9BX95 441 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF408Q9H9D4 720 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A0C4DFX4 3053 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARP10275 920 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RFX1P22670 979 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DMRTA1Q5VZB9 504 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APC2O95996 2303 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AOX1Q06278 1338 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRANK1O15050 2925 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GVY2 172 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VWCEQ96DN2 955 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MYCBP2O75592 4640 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF524Q96C55 264 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSMD3Q7Z407 3707 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KALRNO60229 2985 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF202O95125 648 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC34A2O95436 690 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ODF1Q14990 250 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARHGAP17Q68EM7 881 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DLK2Q6UY11 383 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC51AQ86UW1 340 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SHKBP1Q8TBC3 707 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NELL2Q99435 816 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EMILIN3Q9NT22 766 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LOC100653049A0A140TA62 436 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT34O76011 436 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRB2Q5IJ48 1285 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q7L0L9 218 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa-1.47□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms