RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356575.8

MEGF6-202, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 5,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC7Q96M83 1385 aa25.03■■□□□ 1.6
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.02■■□□□ 1.6
MEGF6-202ENST00000356575 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.02■■□□□ 1.6
MEGF6-202ENST00000356575 HOMER1Q86YM7 354 aa25.01■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.01■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 FGD6Q6ZV73 1430 aa25■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 FOSBP53539 338 aa25■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.99■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC27Q2M243 656 aa24.99■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 PANK1Q8TE04 598 aa24.99■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.97■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 IGF1RP08069 1367 aa24.97■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 FYB1O15117 783 aa24.97■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 CDC45O75419 566 aa24.97■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 KLHL34Q8N239 644 aa24.96■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 MTHFSP49914 203 aa24.96■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 SMARCA4P51532 1647 aa24.96■■□□□ 1.59
MEGF6-202ENST00000356575 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.95■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.95■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 SETQ01105 290 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.95■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 GNAI3P08754 354 aa24.94■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.94■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 CUX1P39880 1505 aa24.94■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.93■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.93■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.93■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 FSD1Q9BTV5 496 aa24.93■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 CNTROBQ8N137 903 aa24.93■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 PSMA5P28066 241 aa24.92■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 XBP1P17861 261 aa24.92■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 ABTB2Q8N961 1025 aa24.92■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.92■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.91■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.91■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.9■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.9■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.9■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
MEGF6-202ENST00000356575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.88■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.87■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 MTMR7Q9Y216 660 aa24.87■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 SDF4Q9BRK5 362 aa24.86■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 PRKAR2BP31323 418 aa24.86■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 OLFM4Q6UX06 510 aa24.86■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 AFAP1Q8N556 730 aa24.86■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 FAM177BA6PVY3 158 aa24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 IFT57Q9NWB7 429 aa24.84■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.84■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.84■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 OFD1O75665 1012 aa24.83■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
MEGF6-202ENST00000356575 ODF2Q5BJF6 829 aa24.82■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 EPS15P42566 896 aa24.82■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 MNS1Q8NEH6 495 aa24.81■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 PPP2R1AP30153 589 aa24.8■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 TEX35Q5T0J7 233 aa24.8■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 HIP1O00291 1037 aa24.8■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 RUFY1Q96T51 708 aa24.8■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.8■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 PRDM2Q13029 1718 aa24.79■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 PRAM1Q96QH2 718 aa24.79■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.79■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 KDM4AO75164 1064 aa24.78■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.78■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 CDR1P51861 262 aa24.78■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 NCOA2Q15596 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 NEK4P51957 841 aa24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 STRN4Q9NRL3 753 aa24.77■■□□□ 1.56
MEGF6-202ENST00000356575 GNAI2P04899 355 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms