RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
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LRRC25-201ENST00000339007 MORC1Q86VD1 984 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 AFAP1Q8N556 730 aa23.39■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.38■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.38■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 TNNQ9UQP3 1299 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRC25-201ENST00000339007 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.34■■□□□ 1.33
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LRRC25-201ENST00000339007 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.3■■□□□ 1.32
LRRC25-201ENST00000339007 ATP7AQ04656 1500 aa23.3■■□□□ 1.32
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LRRC25-201ENST00000339007 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.28■■□□□ 1.32
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LRRC25-201ENST00000339007 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.27■■□□□ 1.31
LRRC25-201ENST00000339007 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.27■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.24■■□□□ 1.31
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LRRC25-201ENST00000339007 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.3
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LRRC25-201ENST00000339007 ADGRB3O60242 1522 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC25-201ENST00000339007 TRAK2O60296 914 aa23.17■■□□□ 1.3
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LRRC25-201ENST00000339007 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.09■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRRC25-201ENST00000339007 EVC2Q86UK5 1308 aa23.08■■□□□ 1.28
LRRC25-201ENST00000339007 RBM25P49756 843 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
LRRC25-201ENST00000339007 CD109Q6YHK3 1445 aa23.06■■□□□ 1.28
LRRC25-201ENST00000339007 ABCC11Q96J66 1382 aa23.06■■□□□ 1.28
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