RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ERC2O15083 957 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP6P59044 892 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 HOMER1Q86YM7 354 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 SMARCA4P51532 1647 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 MIA2Q96PC5 1412 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 SASS6Q6UVJ0 657 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF428Q96B54 188 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRM-201ENST00000332175 ABTB2Q8N961 1025 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 IKQ13123 557 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 FSD1Q9BTV5 496 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 STRN4Q9NRL3 753 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC7Q96M83 1385 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 MTHFSP49914 203 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 GPS2Q13227 327 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRM-201ENST00000332175 SETQ01105 290 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 FGD6Q6ZV73 1430 aa27■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 CDC45O75419 566 aa27■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 CNTROBQ8N137 903 aa27■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.98■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 CUX1P39880 1505 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 NUCB2P80303 420 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 EPS15P42566 896 aa26.95■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 PDILTQ8N807 584 aa26.95■■□□□ 1.91
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 PRKAR2BP31323 418 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 AFAP1Q8N556 730 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2B1P20020 1258 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 IFT57Q9NWB7 429 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 OLFM4Q6UX06 510 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 PRAM1Q96QH2 718 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 IGF1RP08069 1367 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 PSMA5P28066 241 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 XBP1P17861 261 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 ODF2Q5BJF6 829 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.97e-8■■■■■ 186.3
PTPRM-201ENST00000332175 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.89■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PTPRM-201ENST00000332175 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.89■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 SDF4Q9BRK5 362 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM132AQ24JP5 1023 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 GNAI3P08754 354 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R1AP30153 589 aa26.86■■□□□ 1.89
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