RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 NLRP1Q9C000 1473 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 DLC1Q96QB1 1528 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 METP08581 1390 aa24.03■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 NEFLP07196 543 aa24.02■■□□□ 1.44
ACTB-201ENST00000331789 BCANQ96GW7 911 aa24.01■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 ABCC11Q96J66 1382 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 LTKP29376 864 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 CDK19Q9BWU1 502 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 USP32Q8NFA0 1604 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
ACTB-201ENST00000331789 INSRP06213 1382 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 MORC1Q86VD1 984 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.93■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 NUDCQ9Y266 331 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PP64 1363 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.89■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 EID1Q9Y6B2 187 aa23.89■■□□□ 1.42
ACTB-201ENST00000331789 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 SLIT1O75093 1534 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 TECPR2O15040 1411 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 SIRT1Q96EB6 747 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 CABP1Q9NZU7 370 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 CPS1P31327 1500 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 FAM135BQ49AJ0 1406 aa23.86■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 NSD2O96028 1365 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 MED14O60244 1454 aa23.84■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.83■■□□□ 1.41
ACTB-201ENST00000331789 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 PTPRUQ92729 1446 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 PDE3BQ13370 1112 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 FYB1O15117 783 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 MTHFSP49914 203 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 SHPRHQ149N8 1683 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
ACTB-201ENST00000331789 TBX22Q9Y458 520 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 ATP7BP35670 1465 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 CFAP53Q96M91 514 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-201ENST00000331789 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 ADGRB2O60241 1585 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 DIP2AQ14689 1571 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 APAF1O14727 1248 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 ZNF521Q96K83 1311 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 AKAP12Q02952 1782 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 ITSN1Q15811 1721 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-201ENST00000331789 NUTM2FA1L443 756 aa23.64■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 PTCH1Q13635 1447 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA2Q08379 1002 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 NME9Q86XW9 330 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 RUNDC1Q96C34 613 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTB-201ENST00000331789 FBLN1P23142 703 aa23.6■■□□□ 1.37
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