RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 BCAR3O75815 825 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 WWC1Q8IX03 1113 aa29.27■■■□□ 2.28
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3C2BO00750 1634 aa29.26■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 GLI2P10070 1586 aa29.24■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 MORC1Q86VD1 984 aa29.23■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NEFMP07197 916 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 CD109Q6YHK3 1445 aa29.22■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NSD2O96028 1365 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 RUNDC1Q96C34 613 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
HOXD1-201ENST00000331462 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.18■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 AAMPQ13685 434 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC27Q2M243 656 aa29.17■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 WDR63Q8IWG1 891 aa29.16■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.15■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 CLUAP1Q96AJ1 413 aa29.14■■■□□ 2.26
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRB2O60241 1585 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.13■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 NEO1Q92859 1461 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 IGHDP01880 384 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 RGS3P49796 1198 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 EVC2Q86UK5 1308 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP53Q96M91 514 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 ZFYVE9O95405 1425 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 GGT6Q6P531 493 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 ZMYM3Q14202 1370 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 MTHFSP49914 203 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXD1-201ENST00000331462 CANXP27824 592 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 PANK1Q8TE04 598 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 COG6Q9Y2V7 657 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 ABCC11Q96J66 1382 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXD1-201ENST00000331462 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
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HOXD1-201ENST00000331462 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.99■■■□□ 2.23
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HOXD1-201ENST00000331462 NEUROD2Q15784 382 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 MED14O60244 1454 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A3P48751 1232 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 RICTORQ6R327 1708 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP1Q9C000 1473 aa28.95■■■□□ 2.23
HOXD1-201ENST00000331462 A0A1W2PP64 1363 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 RLBP1P12271 317 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRMP28827 1452 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 CABP2Q9NPB3 220 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.89■■■□□ 2.22
HOXD1-201ENST00000331462 IDI1Q13907 227 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 GSE1Q14687 1217 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 RAPGEF3O95398 923 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 TNNQ9UQP3 1299 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 IL16Q14005 1332 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXD1-201ENST00000331462 SEC24BO95487 1268 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXD1-201ENST00000331462 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.8■■■□□ 2.2
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