RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296839.4

FOXQ1-201, Transcript of forkhead box Q1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene FOXQ1, Length 2,309 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1-201ENST00000296839 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
FOXQ1-201ENST00000296839 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.07■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.06■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.06■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.04■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 ABCC11Q96J66 1382 aa35.03■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 NUDCQ9Y266 331 aa35.03■■■■□ 3.2
FOXQ1-201ENST00000296839 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.01■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 KNDC1Q76NI1 1749 aa35■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 METP08581 1390 aa34.99■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 BCANQ96GW7 911 aa34.97■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.96■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.95■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
FOXQ1-201ENST00000296839 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.94■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.92■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 MORC1Q86VD1 984 aa34.92■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 CDK19Q9BWU1 502 aa34.92■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 A0A1W2PP64 1363 aa34.92■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 NSD2O96028 1365 aa34.91■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 TECPR2O15040 1411 aa34.9■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 CPS1P31327 1500 aa34.89■■■■□ 3.18
FOXQ1-201ENST00000296839 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.88■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.88■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.88■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 PDE3BQ13370 1112 aa34.87■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 SLIT1O75093 1534 aa34.86■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.86■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 LTKP29376 864 aa34.86■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 SIRT1Q96EB6 747 aa34.86■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.85■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.83■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.82■■■■□ 3.17
FOXQ1-201ENST00000296839 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.81■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.81■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 ERICH6BQ5W0A0 696 aa34.8■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 MED14O60244 1454 aa34.79■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 SHPRHQ149N8 1683 aa34.79■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.78■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.78■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 EID1Q9Y6B2 187 aa34.77■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
FOXQ1-201ENST00000296839 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 CABP1Q9NZU7 370 aa34.76■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 ATP7BP35670 1465 aa34.75■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.73■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.71■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 ROBO2Q9HCK4 1378 aa34.71■■■■□ 3.15
FOXQ1-201ENST00000296839 MTHFSP49914 203 aa34.69■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 FYB1O15117 783 aa34.67■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC146Q8IYE0 955 aa34.67■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.66■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.66■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 ADGRB2O60241 1585 aa34.66■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 PTPRUQ92729 1446 aa34.66■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 DIP2AQ14689 1571 aa34.65■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.65■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.65■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.65■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF521Q96K83 1311 aa34.64■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 CFAP53Q96M91 514 aa34.64■■■■□ 3.14
FOXQ1-201ENST00000296839 TBX22Q9Y458 520 aa34.62■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 PPP4R2Q9NY27 417 aa34.6■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.6■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 RCAN3Q9UKA8 241 aa34.59■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 APAF1O14727 1248 aa34.59■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.57■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 AKAP12Q02952 1782 aa34.57■■■■□ 3.13
FOXQ1-201ENST00000296839 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 ITSN1Q15811 1721 aa34.56■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.55■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 NGEFQ8N5V2 710 aa34.54■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 PTCH1Q13635 1447 aa34.53■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.53■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa34.53■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 GOLGA2Q08379 1002 aa34.52■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.52■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
FOXQ1-201ENST00000296839 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa34.5■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 RRP1P56182 461 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 RUNDC1Q96C34 613 aa34.49■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.49■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.48■■■■□ 3.11
FOXQ1-201ENST00000296839 SLFN5Q08AF3 891 aa34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms