RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 KANK1Q14678 1352 aa27.07■■□□□ 1.92
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ATP10AO60312 1499 aa27.06■■□□□ 1.92
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CSNK1G2-201ENST00000255641 MYOM1P52179 1685 aa27.05■■□□□ 1.92
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CSNK1G2-201ENST00000255641 RSPH6AQ9H0K4 717 aa27.05■■□□□ 1.92
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.89
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CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP152O94986 1710 aa26.88■■□□□ 1.89
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTPRTO14522 1441 aa26.88■■□□□ 1.89
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CSNK1G2-201ENST00000255641 DEPDC5O75140 1603 aa26.87■■□□□ 1.89
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCA6Q8N139 1617 aa26.77■■□□□ 1.88
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CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.77■■□□□ 1.88
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CSNK1G2-201ENST00000255641 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.75■■□□□ 1.87
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CSNK1G2-201ENST00000255641 GRPEL1Q9HAV7 217 aa26.75■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CFAP53Q96M91 514 aa26.73■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CABP2Q9NPB3 220 aa26.73■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.73■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.71■■□□□ 1.87
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLCN1P35523 988 aa26.7■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 MROH2AA6NES4 1674 aa26.68■■□□□ 1.86
CSNK1G2-201ENST00000255641 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
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