RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 TPM3P06753 285 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 PRAM1Q96QH2 718 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 TIAM1Q13009 1591 aa23.13■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 CPLX1O14810 134 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 ABTB2Q8N961 1025 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 APPP05067 770 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.11■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 DAPK1P53355 1430 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 GNAI3P08754 354 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 MCTP1Q6DN14 999 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 BECN2A8MW95 431 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 WWC1Q8IX03 1113 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRE-201ENST00000254667 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.08■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 LNPKQ9C0E8 428 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 TPM2P07951 284 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 PRKAR2BP31323 418 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 CEP89Q96ST8 783 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 ERICH2A1L162 156 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 PANK1Q8TE04 598 aa23.05■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 CDC45O75419 566 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 TPM1P09493 284 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 NUCB2P80303 420 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 CDK19Q9BWU1 502 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 SLC4A3P48751 1232 aa23.03■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.02■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRE-201ENST00000254667 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 PES1O00541 588 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 ERBINQ96RT1 1412 aa23■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 PDE3AQ14432 1141 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 GSE1Q14687 1217 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 CNTROBQ8N137 903 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 CABP1Q9NZU7 370 aa22.98■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 PSMA5P28066 241 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 IQGAP2Q13576 1575 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 WDR63Q8IWG1 891 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRE-201ENST00000254667 BICD2Q8TD16 824 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 WASHC4Q2M389 1173 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 GCC1Q96CN9 775 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 HIP1O00291 1037 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 RAD21O60216 631 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 RAPGEF3O95398 923 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 FBXW7Q969H0 707 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRE-201ENST00000254667 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.92■■□□□ 1.26
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